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最終更新日: 2018-05-04 23:51

Toxtree: Toxic Hazard Estimation

化学物質の毒性の危険性を推定する GUI アプリケーションです。最新バージョンは、次の毒性予測モジュールを含む:-Cramer のルール (経口毒性) - Verhaar を介してアクションの毒性モード スキーム - 皮膚の炎症や目の炎症の予測 - ベニーニ/ボッサ ルールベースの変異原性および発がん性の予測-開始の生分解性と永続性の予測-皮膚感反応性ドメイン - クルースは TTC デシジョン ツリー - SMARTCyp - Cytochrome P450-Mediated 薬物代謝と代謝予測-in vivo 小核試験の構造警告アッセイの齧歯動物 (ISSMIC) で-構造アラート機能グループ識別 (ISSFUNC)-結合蛋白結合に関連する構造のアラートDNA の結合。-Ames 変異原性 Toxtree を推定への異なるアプローチを組み込むプラグイン フレームワークを提供します。プラットフォームに依存しない (Java で書かれた) 化学開発キットを使って。

(機械翻訳)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存, OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing
最終更新日: 2015-04-03 10:58

MZmine 2

MZmine 2 は Java で書かれた質量分析データの差分解析フレームワークです。

(機械翻訳)
対象ユーザ: 科学/研究
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing
最終更新日: 2007-09-26 00:09

RasTop

!RasTop は蛋白質、核酸、人気 Rasmol ソフトウェアに基づいて小分子の可視化分子グラフィック プログラムです。プログラムは、急速な可視化と分子の解析を目指しています。

(機械翻訳)
対象ユーザ: 科学/研究
オペレーティングシステム: All 32-bit MS Windows (95/98/NT/2000/XP/Vista/7)
プログラミング言語: C, C++
ユーザインタフェース: Win32 (MS Windows)
最終更新日: 2017-07-11 03:53

Gabedit

Gabeditは、Gamess-US, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, Mopac2007, Orca, PC Gamess, そして Q-Chemといった計算化学パッケージのためのグラフィカルユーザーインターフェイスです。

最終更新日: 2016-12-03 05:56

Avogadro

Avogadroは、計算化学、分子モデリング、バイオインフォマティクス、材料科学、およびそれらの関連分野で使用するための高度でクロスプラットフォームな分子エディタです。柔軟なレンダリングのフレームワークと強力なプラグインアーキテクチャを提供しています。

最終更新日: 2017-10-28 12:33

APBS

APBSは、広範囲な長さのスケールの分子溶質間の静電相互作用をを記述する連続体モデルのための、ポアソン・ボルツマン方程式の数値解法のソフトウェアパッケージです。http://apbs.sf.net/

最終更新日: 2018-06-14 01:12

LAMMPS

LAMMPSは並列計算機のために設計された古典的な分子動力学シミュレータです。これは様々な力場と境界条件を使用して、原子、高分子、生物、金属、中規模システムのモデルを作ることができます。また、簡単に変更したり拡張することができます。

最終更新日: 2009-04-14 10:21

DNAStrider

Mac osx 版、もう os9 をサポートしていない Lepard にアップグレードします。このプロジェクトはビルド DNA ストライダー飛竜のヘルプをユーザーが自分のデータを取得し、いくつかの基本的な DNA の実行を分析関数。

(機械翻訳)
データベース環境: SQLite
開発状況: 3 - アルファ
ライセンス: Academic Free License (AFL)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: MacOSX, Linux, Windows XP
プログラミング言語: REALbasic
ユーザインタフェース: Carbon (Mac OS X), KDE, Win32 (MS Windows)
最終更新日: 2014-08-26 05:14

picard

(ジャワ) における次世代シーケンシング形式のデータを BAM (http://samtools.sourceforge.net) を扱うためのツールのセットです。

(機械翻訳)
最終更新日: 2018-01-29 11:41

ERmod

ERmod (エネルギー表現モジュール) は、エネルギー表示法による溶媒和自由エネルギーを計算するためのプログラム (j. 化学物理 113、6070 (2000))。プログラムは、不均一系を含む、任意の溶剤の溶媒和自由エネルギーを計算することができる、NAMD、GROMACS やオレンジなどの最先端の分子シミュレーション ソフトウェアとの連携で実行することができます。

(機械翻訳)
最終更新日: 2015-03-07 05:42

SketchEl

様々なケムインフォマティクスアプリケーションで使用するための化学構造のスケッチツールです。MDL MOLファイルの作成と編集に適しています。

対象ユーザ: 科学/研究
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing
最終更新日: 2007-02-22 17:33

PyMOL Plugins

PyMOL Pluginsは、PyMOLの多くのプラグインを提供することを目指します。このウェブサイト上でPyMOLについてより詳細な情報を見つけることができます:http://www.pymol.org/

対象ユーザ: 教育, 健康産業, 科学/研究
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: C++, Python
ユーザインタフェース: Tk
最終更新日: 2010-04-27 22:26

NMRShiftDB

NMRShiftDB は、化学構造と核磁気共鳴データについては、オープン ソース、オープン アクセス、オープン提出、オープン コンテンツの web データベースです。

(機械翻訳)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Web環境
最終更新日: 2007-06-07 03:42

NOCH

NOC はオープン ソース開発ツールキットおよび表示、タンパク質構造の可視化、解析、結晶学的マッピング、モデリング、および洗練された、Gromacs/アンバー MD 軌道の強力な分子エクスプ ローラー映画作り.

(機械翻訳)
最終更新日: 2006-08-19 01:11

ProbeMaker

!ProbeMaker はオリゴヌクレオチドのプローブのセットの設計のためのフレームワークです。プローブを別のシーケンスの要素の構成のさまざまな種類のデザインをことができます。プラグイン機構で新しい機能を持つフレームワークを拡張をできます。

(機械翻訳)
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing, コマンドライン, Console/Terminal