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遺伝子情報科学
393 件のプロジェクトが条件に合致します
最終更新日: 2019-04-03 02:52

SASHIMI

刺身プロジェクト ホスト トランス プロテオーム パイプライン (TPP)、基づく量産仕様 (MS、MS/MS) のためのツールの成熟したスイート プロテオミクス: 統計的検証、定量、視覚化、および私たちのオープン mzXML 形式に raw の MS データからコンバーター。

(機械翻訳)
最終更新日: 2018-07-19 00:20

SAM tools

SAM (順序アライメント/マップ) は、ヌクレオチド配列アラインメントを格納するための柔軟な汎用的な形式です。サム ツールは線形サム形式で操作することで効率的なユーティリティを提供します。

(機械翻訳)
対象ユーザ: 開発者, 科学/研究
オペレーティングシステム: POSIX (Linux,BSD,Solaris など)
プログラミング言語: C, Perl
ユーザインタフェース: コマンドライン, Curses/Ncurses
最終更新日: 2017-07-01 09:38

Outmoded Bonsai

「受動的に悪を受け入れる者彼はずっと彼の手助けをするそれを犯す人としてそれに関わっている」- マーティンルーサー キング ジュニア。Windows 以外のシステムにイルミナ !BeadStudio/!GenomeStudio モジュールをロードするため mono ベースのフレームワーク。この努力はないによって承認されたまた、イルミナと提携。プロジェクト名は「モノラル !BeadStudio」のアナグラムです。

(機械翻訳)
オペレーティングシステム: OS非依存, POSIX (Linux,BSD,Solaris など)
プログラミング言語: C, C#
ユーザインタフェース: .NET/Mono
最終更新日: 2017-10-28 12:33

APBS

APBSは、広範囲な長さのスケールの分子溶質間の静電相互作用をを記述する連続体モデルのための、ポアソン・ボルツマン方程式の数値解法のソフトウェアパッケージです。http://apbs.sf.net/

最終更新日: 2013-03-03 14:01

The igraph library

これは別のライブラリを作成してグラフを操作するためです。単に他のグラフ ライブラリが扱うことができる著者と直面されるサイズのグラフがありません。たびに可能な igraph もユーザーフレンドリーでポータブルであることを試みます。

(機械翻訳)
最終更新日: 2014-10-27 18:13

BMF

BMF はサーバー プラットフォームもオープン ソースの web アプリケーションを作成するための Java 言語で開発されたソフトウェア フレームワークである臨床、管理およびヘルスケアの会社のための管理。

(機械翻訳)
データベース環境: JDBC, Microsoft Access, IBM DB2, MySQL, Oracle
開発状況: 6 - 成熟
主要対話語: 英語, イタリア語
オペレーティングシステム: J2ME (Java Platform, Micro Edition)
プログラミング言語: JSP, Java, JavaScript, PL/SQL
ユーザインタフェース: Web環境
最終更新日: 2015-06-12 00:10

mspp

質量分析計から得られるデータを解析/表示するためのプログラム『Mass++』の、オープンソース版開発・メンテナンス計画です。 Mass++は2006年、JST(科学技術振興機構)の戦略的創造研究推進事業(CREST)予算によって開発が開始され、2010年からは内閣府・最先端研究開発支援プログラム(FIRST)予算によって開発が続けられました。 2015年3月からMass++はオープンソース化され、3条項BSDライセンスのもとでソースコードが公開されました。今後、このオープンソース版Mass++の開発とメンテナンスは、このサイトを拠点に行われる予定です。

データベース環境: PostgreSQL (pgsql), SQLite
開発状況: 4 - ベータ
対象ユーザ: 科学/研究
主要対話語: 英語, 日本語
オペレーティングシステム: Windows 7
プログラミング言語: C#, C++
トピック: 遺伝子情報科学
ユーザインタフェース: .NET/Mono, wxWidgets
登録日: 2015-02-24 21:51
最終更新日: 2009-04-17 12:44

R

Rは言語であり、統計的な計算やグラフィックのための環境です。Rはベル研究所のJohn Chambersらによって開発されたSに似ています。Rは統計的あるいはグラフィカルな様々な技術(線形/非線形モデリング、統計的テスト、時系列解析、分類、クラスタリングなど)を提供します。Rは繰り返し、条件分岐の制御フロー構造を備えた真のコンピュータ言語として設計されており、新しい関数を定義する事によって機能を追加することができます。負荷の大きい計算タスクを扱う場合、FortranとCのコードをランタイムでリンクして呼び出すことが出来ます。

最終更新日: 2015-03-18 19:20

CARE2X php Integ Hospital Info System

PHP, mySQL, PostgreSQLによる統合病院情報システムです。外科、看護、外来、病棟、研究室、薬局、セキュリティ、入院患者、スケジューラ、修理、通信、その他の機能をサポートします。多言語で、WYSIWYGフォーム、ユーザ毎設定、組み込みボット、モジュラー&スケーラブルという機能、特徴があります。

最終更新日: 2014-06-05 14:28

Wandora

Wandoraは、Topic MapsとJavaに基づく汎用のデータ抽出、管理、および公開アプリケーションです。Wandoraはグラフィカルユーザーインターフェイス、知識の階層表示、いくつかのデータストレージオプション、豊富なデータの抽出、インポートとエクスポート機能、Topic Mapsの動的公開できるようにする組み込みのHTTP サーバを持っています。Wandora は迅速なオントロジー構築と知識のマッシュアップに最適です。

オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
最終更新日: 2013-11-22 08:43

CASP - Comet Assay Software Project

CASP - Comet Assay Software Projectは、comet assayとも呼ばれるSCGE (Single Cell Gel Electrophoresis) 手法によるDNA損傷の測定のために使うクロスプラットフォームな画像解析ソフトウェアです。

最終更新日: 2015-01-29 09:27

MarsBaR ROI toolbox for SPM

!MarsBaR は、関心領域 (Roi) 内の画像データを分析するための matlab ツールボックスです。

(機械翻訳)
開発状況: 4 - ベータ
対象ユーザ: 科学/研究
主要対話語: 英語
最終更新日: 2019-04-18 01:29

Jmol

Jmol/JSmol は、3次元の分子化学構造のためのビュワーで、次のそれぞれ4つのモードで働きます。jQuery を用いる HTML5-only のウェブアプリケーションとして、Java applet として、スタンドアローンの Java プログラム (Jmol.jar) として、そして、"headless" なサーバーサイドのコンポーネント (JmolData.jar)として。 Jmol は次に示すような複数のファイルタイプに対応しています。PDB, CIF, SDF, MOL 形式の他、PyMOL PSE や Spartan のファイル、そして、Gaussian, GAMESS, MOPAC, VASP, CRYSTAL, CASTEP, QuantumEspresso, VMD, およびその他の量子化学計算プログラムからの出力など。 いくつかのデータベース( RCSB, EDS, NCI, PubChem, MaterialsProject )からは、直接ファイルを読み込むことができます。また、複数のファイルを読み込んで、同時に比較することができます。 豊富な記述言語とよく作りこまれた web API によって、ユーザのインターフェイスを簡単に最適化することができます。 インタラクティブなアニメーションと線形のモーフィングなどが可能です。Jmol のインターフェイスは、次のような目的に適しています。分光法における JSpecView、JSME における 2D → 3D 変換、POV-Ray の画像、そして CAD プログラムの 3D プリンティング (VRML export)。

最終更新日: 2018-11-17 00:56

raxmlGUI

ユーザーフレンドリーのグラフィカルなフロント エンドの RAxML (Stamatakis、2006年) を用いた系統解析。ください引用: シルヴェストロ ミハラク (2012) - raxmlGUI: グラフィカルな RAxML のフロント エンド。生物多様性と進化 12、335-337。DOI: 10.1007/s13127-011-0056-0

(機械翻訳)
対象ユーザ: 科学/研究
オペレーティングシステム: MacOSX, Linux, Windows 7, Windows XP
プログラミング言語: Python
ユーザインタフェース: Tk
最終更新日: 2009-03-11 20:55

ploticus

PLOTICUSは棒グラフ、折れ線グラフ、円グラフ、箱ひげ図、散布図、スイープ、ヒートマップ、ベクトル、タイムライン、ベン図、および他のタイプのグラフを生成し、プロットするためのコマンドラインユーティリティです。PLOTICUSはグラフの自動もしくはジャストインタイム生成に有用です。また日付、時刻、およびカテゴリーデータを素敵に処理し、いくつかの基本的な統計機能を有しています。GIF、PNG、SVG、SWF、JPEG、PostScript、EPS、およびX11に出力できます。あなたが便利な設定オプションを使用したり、豊かで詳細な色とスタイルの操作で複雑なスクリプトを作成したりすることもできます。