プロジェクトシンプルリスト ソフトウェアダウンロードマップ

遺伝子情報科学
397 件のプロジェクトが条件に合致します
平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2009-04-17 12:44

R

Rは言語であり、統計的な計算やグラフィックのための環境です。Rはベル研究所のJohn Chambersらによって開発されたSに似ています。Rは統計的あるいはグラフィカルな様々な技術(線形/非線形モデリング、統計的テスト、時系列解析、分類、クラスタリングなど)を提供します。Rは繰り返し、条件分岐の制御フロー構造を備えた真のコンピュータ言語として設計されており、新しい関数を定義する事によって機能を追加することができます。負荷の大きい計算タスクを扱う場合、FortranとCのコードをランタイムでリンクして呼び出すことが出来ます。

平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2014-06-05 14:28

Wandora

Wandoraは、Topic MapsとJavaに基づく汎用のデータ抽出、管理、および公開アプリケーションです。Wandoraはグラフィカルユーザーインターフェイス、知識の階層表示、いくつかのデータストレージオプション、豊富なデータの抽出、インポートとエクスポート機能、Topic Mapsの動的公開できるようにする組み込みのHTTP サーバを持っています。Wandora は迅速なオントロジー構築と知識のマッシュアップに最適です。

オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2009-03-11 20:55

ploticus

PLOTICUSは棒グラフ、折れ線グラフ、円グラフ、箱ひげ図、散布図、スイープ、ヒートマップ、ベクトル、タイムライン、ベン図、および他のタイプのグラフを生成し、プロットするためのコマンドラインユーティリティです。PLOTICUSはグラフの自動もしくはジャストインタイム生成に有用です。また日付、時刻、およびカテゴリーデータを素敵に処理し、いくつかの基本的な統計機能を有しています。GIF、PNG、SVG、SWF、JPEG、PostScript、EPS、およびX11に出力できます。あなたが便利な設定オプションを使用したり、豊かで詳細な色とスタイルの操作で複雑なスクリプトを作成したりすることもできます。

平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2014-10-27 18:13

BMF

BMF はサーバー プラットフォームもオープン ソースの web アプリケーションを作成するための Java 言語で開発されたソフトウェア フレームワークである臨床、管理およびヘルスケアの会社のための管理。

(機械翻訳)
平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2016-10-19 05:13

APBS

APBSは、広範囲な長さのスケールの分子溶質間の静電相互作用をを記述する連続体モデルのための、ポアソン・ボルツマン方程式の数値解法のソフトウェアパッケージです。http://apbs.sf.net/

平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2014-02-17 20:04

SHOGUN

SHOGUNは大規模なカーネル法、特にサポートベクトルマシン(SVM)に重点をおいた機械学習のツールボックスです。様々な種類のSVM実装について汎用のSVMオブジェクトインタフェースを提供し、すべて内部では効率的なカーネル実装を利用します。SVMとリグレッションの他に、SHOGUNは線形判別分析(LDA)、線形計画マシン(LPM)、(カーネル) パーセプトロン、隠れマルコフモデルの学習アルゴリズムも備えています。SHOGUNはC++、Matlab、R、Octave、Pythonで利用可能です。

平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2014-05-21 18:22

mcl-edge

MCL エッジは、大規模ネットワーク分析の統合、コマンドライン駆動のワークベンチです。直径、クラスター係数、トポロジー、およびネットワークのごまかしの最短経路の計算のためのプログラムが含まれています。読み込みおよびネットワークの定める遺伝子発現データを分析するためのモジュール。MCL アルゴリズムは確率的フローに基づくネットワークの高速かつ拡張性の高いクラスター アルゴリズムです。アルゴリズムによって採用フロー プロセスは数学的に音と本質的にプロセスの跡として明らかにされるクラスター構造に結びついています。スレッドの実装では、時間以内に何百万ものノードのネットワークが処理し、バイオインフォマティクス、グラフ クラスタ リング、およびネットワーク解析の分野で広きます。

(機械翻訳)
オペレーティングシステム: POSIX (Linux,BSD,Solaris など)
プログラミング言語: C
平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2008-09-12 04:33

Redet

Redetは、50以上ある検索プログラムやエディタ、プログラミング言語の中からいずれかを用いて正規表現の開発と実行を行なうためのツールであり、他の場所で使用する正規表現の開発をしたり、あるいは、それ自体で検索を行なうツールとして使用したりすることを意図しています。ロケールごとにそれぞれのプログラムについて、利用可能な構成を示すパレットを提供します。各プログラムのプロパティは実行時のテストによって決定され、それらのテストによって、その対象となったプログラムのバージョンとその時のロケールにおいてその決定されたプロパティが正しいということが保証されています。(訳注:どのような正規表現が使えるかを示したり、その正規表現を拾い上げて使ったりする「パレット」が対象プログラムに対して用意されます。そしてそのパレットにどのようなエントリが並ぶかは、実行時に一々テストされ決定されますので、対象プログラムとパレットのエントリの間には乖離が無いということでしょう。)その他の機能には永続的な履歴、豊富なヘルプ、文字入力のさまざまなツールや実行時にロケールを変更する機能を含みます。 Redetは高度に設定可能でUnicodeを完全にサポートします。

平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2014-04-02 15:30

openModeller

openModeller は、さまざまなアルゴリズムを使用して生態学的ニッチなモデリングのためのツールと API を提供する C++ フレームワークです。ジオリファレンスの出現ポイントのセットと一連の環境レイヤーに基づく種の潜在的な分布の予測に使用できます。

(機械翻訳)
平均評価
4.5
投票数 2
ダウンロード
最終更新日: 2007-04-25 03:19

Engauge Digitizer

Engaugeデジタイザは、グラフや地図のイメージを数値に変換するソフトウェアです。イメージファイルは、スキャナから、デジタルカメラ、またはスクリーンショットから取り込むことができます。数値は、画面上で読むことができますし、スプレッドシートにコピーすることもできます。初心者の方にもやさしい直感的なインターフェイスや状況に応じたヘルプ画面の表示を備えています。また、専門家のための機能として、画像の歪み補正、さまざまな座標への対応(直線座標、曲座標、線形、対数)、自動スキャン機能、グラフィカルなプレビュー機能があり、詳細なヘルプも用意されています。

平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2005-04-29 13:55

libmba

libmbaパッケージは、任意のプロジェクトに有用な可能性がある殆ど独立したCモジュールのコレクションです。リンクリスト、ハッシュマップ、プール、スタック、配列を含む通常のADTs、柔軟なメモリアロケータ、CSVパーサー、パス正規化ルーチン、国際化テキストの抽象化、設定ファイルモジュール、ポータブルなセマフォ、条件変数等があります。コードは、個々のモジュールが既存のコードベースへの統合ではなく、ライブラリ全体にコミットするユーザに必要とされるよう設計されました。コードはtypedefを使わず、いくつかのコメント、および広範なマニュアルページを持ち、HTMLドキュメント化しています。

平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2010-12-07 21:51

BALL

生化学的アルゴリズム ライブラリ (ボール) は、分子モデリングと構造バイオインフォマティクスで迅速なアプリケーション開発用のフレームワークです。ボールは分子力学、溶媒和メソッド、比較および蛋白質の構造、ファイルのインポート/エクスポート、NMR シフト予測と可視化の解析を高度なデータ構造体とクラスの広範なセットを提供します。その拡張性が高いオブジェクト指向、汎用プログラミング アプローチから。

(機械翻訳)
平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2002-03-15 07:35

BioJava

BioJavaはバイオインフォマティクスのアプリケーションの迅速な開発のためのJavaコンポーネントの包括的なセットを提供することを目指します。これには、他の重要なバイオインフォマティクスの概念、機能シーケンスを表すためのインターフェイスが含まれます。また、様々な共通フォーマットのシーケンスデータを読み書きし、EnsemblのデータベースとDASとBioCorbaサーバーと通信することができます。

平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2004-09-08 08:40

CARE2X

Care2x(以前はケア2002)は病院や健康管理機構のためのソフトウェアです。これらの組織の様々な既存情報システムを単一の効率的なシステムに統合するために設計されます。お互いに互換性のない複数プログラムのネットワークに固有の問題を解決します。サービス、システム、部署、診療所、プロセス、データ、病院に存在する通信のほぼすべてのタイプを統合することができます。そのデザインは、非医療サービスやセキュリティや保守のような機能でさえ扱うことができます。全ての機能は、Webブラウザからアクセスでき、全てのプログラムモジュールはサーバー側で処理されます。

平均評価
0.0
投票数 0
ダウンロード
最終更新日: 2004-11-02 17:10

Cactus

Cactusは、偏微分方程式を解くシステムのための汎用的なモジュラー並列環境です。 このコードは、数値相対論と計算科学研究グループの国際協調によって多くの年月をかけて開発されました。 任意の偏微分方程式解法システムを解くための移植可能なプラットフォームに供するために使用されます。