MolDS("Mol"ecular "D"ynamics simulation package with "S"emiempirical quantum chemistry)を作っています.まだVer. 0.xの開発中ですので,
正式なtarballの配布はしていませんが,ソースコードは以下のSVNリポジトリから誰でも取得できます.
Ver. 0.4(開発中): http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/trunk
Ver. 0.3.1: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.3.1
Ver. 0.3: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.3.0
Ver. 0.2: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.2.0
Ver. 0.1: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.1.0