画面上でグラフィカルに分子モデルを組み立てるソフトウェア。Mac OS X と Windows で動作する。GAMESS, Gaussian などの計算化学ソフトウェアとの連携、組み込み Ruby インタプリタによる自動編集などの機能を持つ。
本プロジェクトは GitHub へ移行しました。今後の更新は GitHub で行い、こちらでは行いません。
GitHub プロジェクトページ: https://github.com/toshinagata/Molby
公式ホームページ: https://toshinagata.github.io/Molby
Crash on running antechamber/parmchk on PPC Mac is (hopefully) fixed.
Mac: resp and sqm (semiempirial QM calculation invoked by antechamber) caused crash unless gfortran is installed. To fix this, config.h/Makefiles for AmberTools is modified so that gfortran library is statically linked
Occasionally, termination of the subprocess (like antechamber) was not detected properly, and the subprocess was left as a zombie. Improved, but may not be completely fixed.
Loading GAMESS dat file now can be interrupted by ESC.
Disable close box of RubyDialogFrame.
On importing frcmod, atom type with a single character (like "c") was not recognized properly. Fixed.
MO import from GAMESS log/dat files are implemented.
ruby-1.8.7-p160.tar.gz is added (required for building)
PPC Mac での antechamber/parmchk のクラッシュを修正。
Mac: resp, sqm(半経験的量子化学計算)のクラッシュを修正。AmberTools の config.h/Makefile を修正して gfortran のライブラリを静的リンクするようにした。
Antechamber などのサブプロセスの終了が検出できず、ゾンビになっていることがあった。一応修正したが、まだ問題があるかも。
GAMESS dat ファイルの読み込みが ESC で中断できるようになった。
RubyDialogFrame のクローズボタンをなくした。
Frcmod インポート(antechamber/parmchk 後の読み込みを含む)で、原子タイプが一文字のものを正しく読めるように修正。
GAMESS dat, log ファイルから MO を読み込むように修正。
r95: Loading GAMESS dat file now can be interrupted by ESC.
r94: Occasionally, termination of the subprocess (like antechamber) was not detected properly, and the subprocess was left as a zombie. Improved, but may not be completely fixed.
r93: Disable close box of RubyDialogFrame.
r92: On importing frcmod, atom type with a single character (like "c") was not recognized properly. Fixed.
r91: Mac: config.h/Makefiles for AmberTools is modified so that gfortran library is statically linked
r90: ruby-1.8.7-p160.tar.gz is added (required for building)
r89: MO import from GAMESS log/dat files seems to be working. Crash on running antechamber/parmchk on PPC Mac is (hopefully) fixed.
r88: MO import from GAMESS output is being implemented (not complete yet)