SourceForge Forum
norep****@sourc*****
2014年 7月 5日 (土) 12:52:27 JST
このメールはSourceForge.JPのフォーラムからの自動転送です。 注意: このメールに返信しても単に無視されます。 フォーラムメッセージへの返信は以下のURLにアクセスしてください: https://sourceforge.jp/projects/eos/forums/31695/35256/73734/ 投稿者: Takuo Yasunaga (tacyas) [メッセージ #72402 への返信] > 【疑問点】 > 前処理の回答にて、 > > 目的は、方向性を決定することであり、最終的には方向 性を決定すれば、元の画像（ＣＴＦ補正後）をたくさんつ かって、ノイズを落としたほうがよいと考えています。 > > とのことですが、これは角度を完全に決めて３次元像を完 成させてから、元の電顕画像(CTF補正後)(数百枚 ~ 数万枚)を使って出来上がった３次元像のノイズを落として いくという意味でしょうか。(２次元の段階で1枚1枚きっち りノイズを落とすことはせず、３次元像にしてからノイズ を落とす？) はい。そういうことです。２次元でノイズを落とすと云う 事は、何らかの情報を失っています。例えば、ローパスフ ィルタをかければ、結果として、高分解能の構造情報を得 ることはできません。 > > 【考察】 > 「参照付投影角度決定」のMakefileを見ながら、単粒子解析 の流れは以下のようになると考えました。 > > (処理A) > 電顕画像(2Dスタック)(数百枚 ~ 数万枚？) > ↓ 前処理(CTF補正、ノイズ除去など) > 補正画像(2Dスタック): データA > > (処理B) > PDBファイルまたは元データなし > ↓ pdb2mrc, mrcImageCreateなど > 参照画像(3D) > ↓ mrc3Dto2D > 参照投影像(2Dスタック): データB > > (処理C) > (データA) + (データB) > ↓ mrcImageAutoRotationCorrelationおよびmakefileのような書き込み 処理 > 3dInfoファイル(mrc2Dto3D -Iで使用する): データC > > (処理D) > (データA) + (データC) > ↓ mrc2Dto3D > ３次元像: (データD) > > (繰り返し処理) > データDを新たな参照画像(3D)にする > ↓ > 処理B - D を繰り返し > > > このループの完了データは前処理後の電顕画像と同程度の ノイズ入り３次元像になると思います。 > なので、ここで出来上がった３次元像のノイズ除去を行う 処理を入れるないようにしようと思っています。 この部分で、ノイズ除去をいれるべきかどうかは、できあ がった3次元像の質に依存します。枚数が少なく、ノイズが 多い場合は、次の比較のための参照像がノイズが多くなり 、その結果、角度決定の確度、精度が悪くなってしまいま す。そのため、フィルタをかけたものを利用します。 以上です。 ______________________________________________________________________ Eos-Image Analysis Environment プロジェクトはフォーラムへの投稿をプロジェクトメンバーに メール送信するように設定されています。 設定の詳細に関しては、プロジェクト管理者に確認してください。
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