NGSEP

プロジェクト概要

NGSEP （次世代シーケンス Eclipse プラグイン）、高スループット シーケンスの分析のための統合的枠組みを読み取ります。NGSEP の主な機能は、変種の検出器は、同時 SNVs、小さな indels の扱い、CNVs を検出することができます。NGSEP はまた bowtie2 参照ゲノムおよび線形並べ替え、別のサンプル、およびバリアントの機能アノテーションからバリアントのマージなどの他のユーティリティへのマッピングを実行するためのユーザー インターフェイスを提供します。NGSEP は、主要な Java 開発環境の一つである Eclipse に基づいています。注: ユーザーのさまざまな種類の分布の異なる選択肢を提供しています、のでクイック ダウンロード (緑)] ボタンをもたらさないかもしれないする必要がある製品のバージョン。データ分析環境に適した NGSEP のディストリビューションを選択する web ページをご覧ください。