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BSpipe はシーケンス品質管理から包括的なパイプラインで領域をメチル化特異的機能解析へのマッピング: (1) シーケンス品質評価、(2) 洗浄 (3) シーケンス読むマッピング シーケンスは、（4） のメチル化の定量 (5) の Dmr (特異的メチル化領域)、Dmr の注釈 (6)、(7) 機能解析可視化用の入力ファイルの生成 (8) 特異的メチル化遺伝子の同定、メチル化プロファイルに基づく (4) のサンプルの比較、および OxBS seq タブ seq など高度なシーケンス テクノロジー （9） サポート マップ-it とノーム seq。
