文字変換テーブルからの漏れ
ibus-anthyの変換テーブル tables.pyの記述中、かな入力の濁点付きに対応するkana_voiced_consonant_no_ruleに「ぼ」に対応するものが抜けています。
.. u'へ' : u'べ', } ではなく、 .. u'へ' : u'べ', u'ほ' : u'ぼ', } となる必要があると思います。
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