ダウンロードリスト

プロジェクト概要

BioPAX は、統合、両替、可視化、生物学的経路データの分析のための標準言語です。BioPAX 経路データ グループ間のデータ交換をサポートし、こうして経路データの受け入れの標準形式を提供することによってデータ形式間での交換の複雑さを軽減します。経路表示については、明確に定義された意味での標準を提供することによって BioPAX 経路データベースやソフトウェアをより効率的に操作することができます。さらに、BioPAX データベースから経路可視化の開発を可能し、知識との組合せで実験的に生成されたデータの分析を容易にします。BioPAX 努力は密接と調整を他の経路の関連標準への取り組みすなわち;PSI MI、SBML、CellML、および重なり合うエリアで互換性のある標準を提供するために取り決めです。このプロジェクトには、BioPAX 仕様、マニュアル、Paxtools Java API および BioPAX バリデーターが含まれています。

システム要件

オペレーティングシステム: OS非依存

ダウンロードパッケージ一覧

最新ファイル(5件)
名前 サイズ 日付 ダウンロード数
biopax-validator-5.0.0-SNAPSHOT-all.zip 59.8 MB 2019-11-14 14:59 0
biopax-validator-4.0.0-all.zip 100.7 MB 2018-09-14 11:19 0
paxtools-5.1.0.jar 12.1 MB 2018-09-13 02:48 2
biopax-validator-4.0.0-SNAPSHOT-all.zip 100.7 MB 2018-04-25 12:54 11
paxtools-5.0.1.jar 12.0 MB 2017-05-09 08:03 2
その他全ファイル
validator
biopax-validator-5.0.0-SNAPSHOT-all.zip59.8 MB2019-11-14 14:590
biopax-validator-4.0.0-all.zip100.7 MB2018-09-14 11:190
biopax-validator-4.0.0-SNAPSHOT-all.zip100.7 MB2018-04-25 12:5411
README-VALIDATOR.txt10.3 KB2014-05-14 22:302
biopax-validator-3.0.3-all.zip84.7 MB2013-12-20 06:178
biopax-validator-2.2.0.zip18.4 MB2012-11-15 09:528
paxtools
paxtools-5.1.0.jar12.1 MB2018-09-13 02:482
paxtools-5.0.1.jar12.0 MB2017-05-09 08:032
paxtools-5.0.0.jar12.0 MB2017-04-27 10:145
paxtools-4.3.1.jar25.1 MB2015-09-30 03:317
paxtools-4.3.1-no-jena.jar16.3 MB2015-09-29 04:0910
paxtools-4.3.0-no-jena.jar13.7 MB2014-11-06 04:286
paxtools-4.3.0.jar21.8 MB2014-11-06 04:283
paxtools-4.2.1-no-jena.jar5.8 MB2013-11-05 00:503
paxtools-4.2.1.jar14.0 MB2013-11-05 00:5016
paxtools.pdf222.5 KB2013-06-28 01:3025
paxtools-4.2.0-no-jena.jar5.1 MB2013-05-19 13:386
paxtools-4.2.0.jar13.2 MB2013-05-19 13:385
README-PAXTOOLS.txt0.4 KB2013-04-08 23:0210
paxtools-4.1.6.jar16.1 MB2013-01-27 21:391
paxtools-4.1.6-no-jena.jar8.0 MB2013-01-27 21:222
python-readme.txt1.6 KB2011-09-09 23:4520
pythonPaxtoolsExample.py3.7 KB2011-09-09 23:457
other
cytoscape2_plugins
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cpath2.jar1.8 MB2010-08-28 04:312
biopax.jar1.3 MB2010-08-28 04:275
webprotege-projects-20130309.zip57.6 KB2013-04-09 23:476
Level3updateWorkshopNov2009.ppt411.0 KB2013-03-31 13:353
IntroducingTheBioPAXValidatorNov2009.pdf251.2 KB2013-03-31 13:3519
BioPAXTutorialNov2009.ps25.2 MB2013-03-31 13:343
BioPAXTutorialNov2009.ppt7.0 MB2013-03-31 13:283
BioPAXTutorialNov2009.pdf6.5 MB2013-03-31 13:2625
BioPAXISMB2010_NADIA.pdf2.8 MB2013-03-31 13:2430
README.md0.3 KB2013-03-31 13:223
HARMONY2011
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Van_Iersel_combine_layout_wkgrp.pdf147.7 KB2013-03-28 05:3330
sbml-status-2011-04-21_MH.pdf3.0 MB2013-03-28 05:3314
SBGNMLInDetails.pdf652.9 KB2013-03-28 05:3322
SBGNQuiz-Emek.pdf22.8 KB2013-03-28 05:3337
RobinHaw2011_Outreach_Harmony.ppt1.6 MB2013-03-28 05:331
NLN_kisao.pdf748.6 KB2013-03-28 05:3324
RichardAdams-SEDML_Harmony.pdf1.5 MB2013-03-28 05:3320
Nadia_MakingBioPAXSPARQLHarmony.pdf1.2 MB2013-03-28 05:3326
Monday_InstallingBuildingLibSBML.pptx2.8 MB2013-03-28 05:331
mhucka-poster-intro-2011-04-17.pdf4.1 MB2013-03-28 05:3324
mhucka-sbml-overview-2011-04-17.pdf3.3 MB2013-03-28 05:3324
libSBML_Tutorial_Getting-started.ppt825.5 KB2013-03-28 05:336
JSBML-HARMONY_2011.pptx1.3 MB2013-03-28 05:333
libSBML_Intro_HARMONY_2011.ppt441.5 KB2013-03-28 05:332
HARMONYSBGNPD-StuartM.pptx275.4 KB2013-03-28 05:331
HARMONY-SBGN-Le_Novere.pdf558.0 KB2013-03-28 05:3343
HARMONY-ER-Le_Novere.pdf868.5 KB2013-03-28 05:3324
HARMONY-ModelsForAll-NLeN.pdf425.2 KB2013-03-28 05:3320
Harmony_presentation_SBML2OWL_MD.pdf1.5 MB2013-03-28 05:3321
BioPAXOverviewHarmony2011.pdf58.6 KB2013-03-28 05:3317
DavidNickersonCellML-SED-ML.pdf1.3 MB2013-03-28 05:3317
BioPAXHarmony-Intro.pptx848.1 KB2013-03-28 05:333
AndreaWIP-HarmonyNotes.pdf2.9 MB2013-03-28 05:3328
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Level3updateWorkshopNov2009.ppt411.0 KB2010-02-12 04:372
BioPAXTutorialNov2009.pdf6.5 MB2010-02-12 04:2933
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