E-Cellシステム (E-Cell System) とは、オブジェクト指向に基づいた、大規模かつ複雑な細胞をモデリング、シミュレーション、解析するためのソフトウェアプラットフォームです。その特徴的な機能として、異なる種類の計算アルゴリズムを異なるタイムスケールで統合してシミュレーションすることができます。コアシステムはC++により記述され、そのフロントエンド部はPython言語によって記述されています。