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GNS3は、複雑なネットワークトポロジを設計するためのグラフィカルなネットワークシミュレータです。単純なワークステーションからパワフルなCiscoルーターまでの幅広いデバイスの設定とシミュレーションを行うことができます。Dynamips、Pemu/QEMU、Dynagenをベースにしています。

Webベースの共同研究ためのぷらっとホームとハイパフォーマンスコンピューティングのインターフェース、仮想研究室を実装するためのツールです。

Rigs of Rodsは、精密でユニークなソフトボディの物理エンジンを使用した、運転、飛行、航海が行える様々な車両の3Dシミュレータのゲームです。

Nsは、研究ネットワークをターゲットにした離散事象シミュレータです。 Nsは、TCPシミュレーション、ルーティング、有線および無線(ローカルおよび衛星)ネットワーク上でのマルチキャストプロトコルのためのサポートを提供します。

Sweet Home 3D は、インテリアデザイン用のJavaアプリケーションです。エンドユーザが作成した2Dの間取りプランに家具を配置し、3Dでプレビューできます。

Canteraは、化学反応速度、熱力学、輸送プロセスといった問題のためのオブジェクト指向のソフトウェアスイートです。Matlab, Python, C++, Fortranを使用しています。

APBSは、広範囲な長さのスケールの分子溶質間の静電相互作用をを記述する連続体モデルのための、ポアソン・ボルツマン方程式の数値解法のソフトウェアパッケージです。http://apbs.sf.net/

Neurophは、ニューラルネットワークの軽量なJavaフレームワークであり、共通の神経回路網のアーキテクチャを開発するために使用することができます。基本的なニューラルネットワークの概念に一致する少数の基本的なクラスと、容易に使え、学習することができるGUIエディタがあります。

OpenFOAM - The Open Source CFD Toolbox。OpenFOAMは、数値流体力学(CFD)のための標準的でプログラミング可能なソフトウェアツールです。詳細は http://www.openfoam.org

Project Apollo - NASSP (NASSPまたはNCPPとしても)は、オービター宇宙飛行シミュレータのためのアドオンです。Project Apolloは、アポロ計画の地球と月の軌道、および実際には飛ばなかったポストアポロ計画をシミュレートします。

DWSIMはVB.NETで書かれ、先進的な熱力学計算、石油の特性化、完全機能のGUIを介してアクセス可能な仮説コンポーネントユーティリティを備えたオープンソースの化学プロセスシミュレータです。

高速で、控えめで、現代的なクロスプラットフォームGUIツールキットです。ハードウェアアクセラレーションの機能を十分に引き出すことができ、シンプルなフレームバッファインタフェースもサポートしています。スタンドアロンであり、新しいプラットフォームやグラフィックシステムに容易に移植できます。

SUMOは、主にドイツ航空宇宙センター（DLR）が開発している顕微鏡と継続的な道路交通シミュレーションソフトウェアです。