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最終更新日: 2017-05-25 20:35

The Chemistry Development Kit

Chemistry Development Kit(CDK)は、バイオ/ケモインフォマティクスおよび計算化学の為のJavaライブラリです。JChemPaint, SENECA, NMRShiftDBのようなプロジェクトで利用され、その他にも多くのプロジェクトで使用されます。

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最終更新日: 2009-04-02 20:24

Expertomica Metabolite Profiling

EDA は、グラフィカル ユーザー インターフェイスと Matlab LC MS または確率法に基づく GC/MS のろ過のためのアプリケーションをコンパイルします。含むピークし、さまざまな可視化を用いた領域分割を化合物します。メタボロミクス、プロテオミクスのこのソフトウェアを使用することができます。

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対象ユーザ: 健康産業, 科学/研究
ライセンス: Academic Free License (AFL)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: Windows, Windows XP
プログラミング言語: MATLAB
ユーザインタフェース: Win32 (MS Windows)
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最終更新日: 2006-11-22 02:35

labTimer

labTimer は黒と白のフィルム加工に適してタイマーのセットです。現時点では、プログラムすることができます開発、修正、および洗濯、アラームと素敵なカウント ダウンの基本的なシーケンスに従ってください。

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最終更新日: 2007-07-16 04:01

Biomolecule Toolkit

生体分子のツールキットは、生体高分子の構造モデリングのためのオープン ソース ライブラリです。ツールキットは分子モデリング、設計、解析ツールの開発を容易に計算の構造生物学で一般的なタスクのための C++ のインターフェイスを提供します。

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最終更新日: 2007-01-28 22:46

PyMOlyze

PyMOlyze は、量子化学 (DFT) 計算の結果を分析するためのグラフィカル プログラムです。以下の分析は分子のフラグメントをユーザー定義に対応しています: マリケン人口分析 (MPA)、C 乗人口分析 (SCPA)、人口分析の重複、マイヤーの結合の注文。QM パッケージがサポートされますガウス、ADF、GAMESS (米国)、GAMESS (英国) と PCGAMESS。

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主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Python
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最終更新日: 2006-12-21 09:24

QuteMol

!QuteMol は、インタラクティブな高品質の分子可視化システムです。!QuteMol は革新的な視覚効果の配列を提供する OpenGL シェーダーを通じて現在の Gpu の機能を悪用します。!QuteMol 可視化技術は明快さと三次元形状の理解しやすく、大規模な分子や複雑な蛋白質の構造の改善を目指します。

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最終更新日: 2005-09-07 10:54

Vigyaan

Vigyaanは、バイオインフォマティクス、計算生物学、計算化学のための電子ワークベンチです。これは、必要なソフトウエアをすべて含んだ、LinuxベースのライブCDで、モデリングソフトウエアが、使用する準備ができた状態でコンピュータを起動させることができる。Artemis、Bioperl、 BLAST (NCBI-tools)、 ClustalX、 Cn3D、EMBOSS tools、Garlic、GROMACS、Ghemical、GNU R、Gnuplot、GIMP、ImageMagick、JMol、MPQC、NJPlot、Open Babel、Octave、PSI3、PyMOL、Rasmol、Raster3D、SMILE、TINKER、XDrawChem、Xmgr、Xfigを含みます。

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最終更新日: 2004-05-02 17:42

EasyChem

EasyChemは高品質な分子や化学式を描くように設計されています。 (とりわけ有機分子で。)また多くのフォーマットにエクスポートすることができます。 (例えば、PostScript、LaTeX、Fig)

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最終更新日: 2006-05-19 09:56

Brabosphere

Brabosphere は分子システムとその特性 3 D 可視化のためのプログラムです。その名前は由来量子力学プログラム パッケージ BRABO、それは、グラフィカルなフロント エンドとして機能するため。解析と可視化結果いくつか他の量子力学的アプリケーションからも受け付けておりますので、計算のこのタイプから作成されたデータを使用することもできます。

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最終更新日: 2017-09-15 12:37

Jmol

Jmolは、Javaで作成された分子の3次元の化学構造を表示するためのプログラムです。さまざまな形式の構造データ・ファイルや量子化学計算プログラムによる出力結果及び複数フレームのアニメーション・ファイルや量子化学計算プログラムで計算された基準振動モードを読み込みむことができます。

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最終更新日: 2006-04-27 01:40

SimSoup

!SimSoup は、[/projects/freshmeat_linux/ Linux] と Windows のグラフィカルな人工化学シミュレータです。プログラムは、分子の種類とそれらの間の可能な相互作用の観点から定義する化学を使用できます。シミュレーション実行は、原子炉で各種分子の分子の数を設定し、場所を取る時間の期間にわたって相互作用を許可する必要があります。リアクターで行われているの相互作用がグラフィカルに表示に表示されます。プログラムの開発のための動機は特にに関連して、ネットワークの行動に調査を有効にする ' 代謝最初」理論生命の起源の基本設計を相互作用の任意のネットワークのモデリングをサポートしていますが起こることができるノード間。現在、開発はプロトタイプ段階に達しています。

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最終更新日: 2005-12-03 22:39

JChemPaint Applet and Swing Application

JChemPaint アプレットと Swing アプリケーションはほとんどの化学教科書で見つけられるそれらのような二次元化学構造を描画するための Java プログラムです。それは化学開発のキット (cdk.sf.net) に基づいています。Http://jchempaint.github.com ダウンロード、追跡、およびソース コード リポジトリで掲載することができます。

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最終更新日: 2005-08-23 10:24

Isotopic Pattern Calculator

IPC (同位体パターン電卓) は化学式またはペプチッド シーケンスの同位体比分布を計算する質量分析のためのツールです。Gnuplot を使用して、結果を視覚化します。

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最終更新日: 2006-07-10 07:06

kfile_chemical

kfile_chemical は化学ドキュメントからメタデータを抽出する KDE デスクトップ用の kfile プラグインのセットです。このメタデータは Kat のようなデスクトップ検索エンジンによって使用することができます。PDB ファイル、MDL mol/sd, 慢性骨髄性白血病、発生してしまうと CIF ファイルをサポートしています。

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オペレーティングシステム: Cygwin (MS Windows), POSIX (Linux,BSD,Solaris など), Windows, Windows
プログラミング言語: C++
ユーザインタフェース: KDE
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最終更新日: 2016-02-16 02:19

GaussSum

GaussSumは、有益な情報(構造最適化の進行状況、UV/IR/ラマンスペクトル、MO係数、他)を抽出するためにADF、GAMESS、GAMESS-US、Gaussianの出力を解析します。