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50 件のプロジェクトが条件に合致します
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最終更新日: 2007-02-22 17:33

PyMOL Plugins

PyMOL Pluginsは、PyMOLの多くのプラグインを提供することを目指します。このウェブサイト上でPyMOLについてより詳細な情報を見つけることができます:http://www.pymol.org/

対象ユーザ: 教育, 健康産業, 科学/研究
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: C++, Python
ユーザインタフェース: Tk
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最終更新日: 2014-08-26 05:14

picard

(ジャワ) における次世代シーケンシング形式のデータを BAM (http://samtools.sourceforge.net) を扱うためのツールのセットです。

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最終更新日: 2017-03-31 04:38

LAMMPS

LAMMPSは並列計算機のために設計された古典的な分子動力学シミュレータです。これは様々な力場と境界条件を使用して、原子、高分子、生物、金属、中規模システムのモデルを作ることができます。また、簡単に変更したり拡張することができます。

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最終更新日: 2015-03-23 04:50

Toxtree: Toxic Hazard Estimation

化学物質の毒性の危険性を推定する GUI アプリケーションです。最新バージョンは、次の毒性予測モジュールを含む:-Cramer のルール (経口毒性) - Verhaar を介してアクションの毒性モード スキーム - 皮膚の炎症や目の炎症の予測 - ベニーニ/ボッサ ルールベースの変異原性および発がん性の予測-開始の生分解性と永続性の予測-皮膚感反応性ドメイン - クルースは TTC デシジョン ツリー - SMARTCyp - Cytochrome P450-Mediated 薬物代謝と代謝予測-in vivo 小核試験の構造警告アッセイの齧歯動物 (ISSMIC) で-構造アラート機能グループ識別 (ISSFUNC)-結合蛋白結合に関連する構造のアラートDNA の結合。-Ames 変異原性 Toxtree を推定への異なるアプローチを組み込むプラグイン フレームワークを提供します。プラットフォームに依存しない (Java で書かれた) 化学開発キットを使って。

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主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存, OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing
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最終更新日: 2015-08-24 22:39

mzmatch

mzMatch は小さなコマンドライン ツール メタボロミクス データ分析の特定の Java コレクションです。ツールは、質量分析の特定の機能と PeakML ファイル形式へのアクセスを提供する PeakML コア ライブラリの上に構築されます。

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開発状況: 4 - ベータ
対象ユーザ: 開発者, 科学/研究
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: C, Java, S/R
ユーザインタフェース: Java SWT
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最終更新日: 2012-07-25 21:06

u/sbmv2012

このプロジェクトの目的は、環境試料から得られた dna の分類の割り当ての自動パイプライン作成します。これらのシーケンスの分類割り当てに底生環境試料から得られた生シーケンス データを処理する python スクリプトのシリーズを開発、最終的にリレーショナル データベース内のすべてのデータを統合します。

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対象ユーザ: 科学/研究
プログラミング言語: Python
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最終更新日: 2016-11-22 17:43

BioNLP-Corpora

BioNLP コーパスは biomedically と言語的コーパスと医用データ ソースのリポジトリです。このプロジェクト内の別々 のパッケージで利用できる多くのリソースがあります。

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最終更新日: 2009-05-01 07:15

cnsFace

cnsFace は、結晶解析や NMR システムのための GUI です。

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開発状況: 2 - プレ アルファ
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Python
トピック: SourceForge.net, 分子科学
ユーザインタフェース: wxWidgets
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最終更新日: 2016-07-09 03:21

LOOS

ロースは C++ で書かれた分子シミュレーション データを分析するための新しいツールを作成するための軽量オブジェクト指向ソフトウェア ライブラリです。主な設計目標は、簡単にメソッドを実装する新しい分析のカジュアルなプログラマーを許可します。

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最終更新日: 2017-03-10 18:20

STochastic Engine for Pathway Simulation

シグナリング経路生物細胞の発生のための確率論的シミュレータ。3 D 四面体メッシュの反応拡散プロセスを処理します。

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最終更新日: 2017-07-26 17:46

DEEP

1995 年に片輪値段導入微分進化計算ノードごとに 1 つの枝に分かれています、人口と見なされます。差分進化完全並列メソッドは、変更することがなく、個人を生き残ったのイテレーションの数として定義されている個々 の年齢を考慮します。導入された改善は: (I) (k + 1) でいくつかの古い個人許可回支店 kth 支店、(II) 新しい選択ルールから最高のものの同じ番号で上書きすることは、子孫評価でいくつかの目的関数を使用して。この作品は SYSPATHO FP7 プロジェクト №260429 でサポートされています (http://www.syspatho.eu/)、RFBR 助成金 10-01-00627-は、11-01-00573-は、11-04-001162-は、状態と契約をロシア科学省 №14.740.11.0166 №11.519.11.6041

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主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: C
ユーザインタフェース: Console/Terminal
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最終更新日: 2009-05-08 11:28

AutoDock Software in Parallel with GPUs

このプロジェクトの CUDA API を使用して NVIDIA の Gpu で並列に実行する !AutoDock ソフトウェアを変更します。ユーザーがダウンロードして、コードをコンパイルし、!AutoDock CUDA 対応グラフィックス カードを使用することができます。Autodock は http://autodock.scripps.edu/に位置して

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開発状況: 4 - ベータ
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: POSIX (Linux,BSD,Solaris など), BSD
プログラミング言語: C, C++
ユーザインタフェース: コマンドライン, Console/Terminal
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最終更新日: 2011-01-18 09:43

vancouvershortr

このパッケージは短い読み取り DNA シーケンシング技術で使用するためのコードが含まれているし、チップ Seq、シーケンス処理全体トランスクリプトーム散弾銃、全ゲノムの散弾銃の配列、SNP 検出、転写産物発現およびファイル変換パッケージが含まれています。

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最終更新日: 2016-09-07 19:30

Molby - 分子モデリングソフトウェア

画面上でグラフィカルに分子モデルを組み立てるソフトウェア。Mac OS X と Windows で動作する。GAMESS, Gaussian などの計算化学ソフトウェアとの連携、組み込み Ruby インタプリタによる自動編集などの機能を持つ。 公式ホームページ: http://molby.sourceforge.jp/

開発状況: 4 - ベータ
対象ユーザ: 科学/研究
主要対話語: 英語, 日本語
オペレーティングシステム: MacOSX, Windows XP
プログラミング言語: C, C++, Ruby
トピック: 化学, 分子力学, 分子科学
ユーザインタフェース: wxWidgets
登録日: 2010-01-21 01:18
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最終更新日: 2010-04-27 22:26

NMRShiftDB

NMRShiftDB は、化学構造と核磁気共鳴データについては、オープン ソース、オープン アクセス、オープン提出、オープン コンテンツの web データベースです。

(機械翻訳)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Web環境