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50 件のプロジェクトが条件に合致します
最終更新日: 2007-01-23 00:34

glare

GLAREは、化学コンビナトリアルライブラリーデザインのコンテキストで製品の試薬リストベースの最適化のためのソフトウェアとライブラリです。大容量の仮想コンビネーショナルライブラリは、秒単位で最適化されている10 12製品を含有する。

最終更新日: 2009-05-08 11:28

AutoDock Software in Parallel with GPUs

このプロジェクトの CUDA API を使用して NVIDIA の Gpu で並列に実行する !AutoDock ソフトウェアを変更します。ユーザーがダウンロードして、コードをコンパイルし、!AutoDock CUDA 対応グラフィックス カードを使用することができます。Autodock は http://autodock.scripps.edu/に位置して

(機械翻訳)
最終更新日: 2011-01-18 09:43

vancouvershortr

このパッケージは短い読み取り DNA シーケンシング技術で使用するためのコードが含まれているし、チップ Seq、シーケンス処理全体トランスクリプトーム散弾銃、全ゲノムの散弾銃の配列、SNP 検出、転写産物発現およびファイル変換パッケージが含まれています。

(機械翻訳)
最終更新日: 2006-08-19 01:11

ProbeMaker

!ProbeMaker はオリゴヌクレオチドのプローブのセットの設計のためのフレームワークです。プローブを別のシーケンスの要素の構成のさまざまな種類のデザインをことができます。プラグイン機構で新しい機能を持つフレームワークを拡張をできます。

(機械翻訳)
最終更新日: 2007-06-07 03:42

NOCH

NOC はオープン ソース開発ツールキットおよび表示、タンパク質構造の可視化、解析、結晶学的マッピング、モデリング、および洗練された、Gromacs/アンバー MD 軌道の強力な分子エクスプ ローラー映画作り.

(機械翻訳)
最終更新日: 2010-04-27 22:26

NMRShiftDB

NMRShiftDB は、化学構造と核磁気共鳴データについては、オープン ソース、オープン アクセス、オープン提出、オープン コンテンツの web データベースです。

(機械翻訳)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Web環境
最終更新日: 2007-02-22 17:33

PyMOL Plugins

PyMOL Pluginsは、PyMOLの多くのプラグインを提供することを目指します。このウェブサイト上でPyMOLについてより詳細な情報を見つけることができます:http://www.pymol.org/

対象ユーザ: 教育, 健康産業, 科学/研究
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: C++, Python
ユーザインタフェース: Tk
最終更新日: 2015-03-07 05:42

SketchEl

様々なケムインフォマティクスアプリケーションで使用するための化学構造のスケッチツールです。MDL MOLファイルの作成と編集に適しています。

対象ユーザ: 科学/研究
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing
最終更新日: 2018-01-29 11:41

ERmod

ERmod (エネルギー表現モジュール) は、エネルギー表示法による溶媒和自由エネルギーを計算するためのプログラム (j. 化学物理 113、6070 (2000))。プログラムは、不均一系を含む、任意の溶剤の溶媒和自由エネルギーを計算することができる、NAMD、GROMACS やオレンジなどの最先端の分子シミュレーション ソフトウェアとの連携で実行することができます。

(機械翻訳)
最終更新日: 2009-04-14 10:21

DNAStrider

Mac osx 版、もう os9 をサポートしていない Lepard にアップグレードします。このプロジェクトはビルド DNA ストライダー飛竜のヘルプをユーザーが自分のデータを取得し、いくつかの基本的な DNA の実行を分析関数。

(機械翻訳)
データベース環境: SQLite
開発状況: 3 - アルファ
ライセンス: Academic Free License (AFL)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: MacOSX, Linux, Windows XP
プログラミング言語: REALbasic
ユーザインタフェース: Carbon (Mac OS X), KDE, Win32 (MS Windows)
最終更新日: 2018-06-14 01:12

LAMMPS

LAMMPSは並列計算機のために設計された古典的な分子動力学シミュレータです。これは様々な力場と境界条件を使用して、原子、高分子、生物、金属、中規模システムのモデルを作ることができます。また、簡単に変更したり拡張することができます。

最終更新日: 2018-05-04 23:51

Toxtree: Toxic Hazard Estimation

化学物質の毒性の危険性を推定する GUI アプリケーションです。最新バージョンは、次の毒性予測モジュールを含む:-Cramer のルール (経口毒性) - Verhaar を介してアクションの毒性モード スキーム - 皮膚の炎症や目の炎症の予測 - ベニーニ/ボッサ ルールベースの変異原性および発がん性の予測-開始の生分解性と永続性の予測-皮膚感反応性ドメイン - クルースは TTC デシジョン ツリー - SMARTCyp - Cytochrome P450-Mediated 薬物代謝と代謝予測-in vivo 小核試験の構造警告アッセイの齧歯動物 (ISSMIC) で-構造アラート機能グループ識別 (ISSFUNC)-結合蛋白結合に関連する構造のアラートDNA の結合。-Ames 変異原性 Toxtree を推定への異なるアプローチを組み込むプラグイン フレームワークを提供します。プラットフォームに依存しない (Java で書かれた) 化学開発キットを使って。

(機械翻訳)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存, OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing
最終更新日: 2009-11-01 23:10

GSLtools

第三の生命鎖である「糖鎖」の質量スペクトルを解析するソフトウェアを開発するプロジェクトです。MALDI-TOF MSやESI-MSなどの質量分析器のデータからタンパク質の分子構造を同定するMS-fitやMascotの様なソフトウェアの技術を応用し開発しています。本プロジェクトにより、バイオインフォマティクス分野において、糖鎖関連の研究が活発化することを期待しています。

本プロジェクトのソフトウェアは下記のサイトに公開しています。 http://www.gsltools.sk.ritsumei.ac.jp/jpn.htm

開発状況: 4 - ベータ
ライセンス: Apache License V2.0
主要対話語: 英語, 日本語
オペレーティングシステム: MacOS, Linux, Windows
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing, Web環境
登録日: 2009-10-25 12:24

MolDS

MolDS("Mol"ecular "D"ynamics simulation package with "S"emiempirical quantum chemistry)を作っています.まだVer. 0.xの開発中ですので, 正式なtarballの配布はしていませんが,ソースコードは以下のSVNリポジトリから誰でも取得できます.



Ver. 0.4(開発中): http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/trunk
Ver. 0.3.1: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.3.1
Ver. 0.3: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.3.0
Ver. 0.2: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.2.0
Ver. 0.1: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.1.0

開発状況: 3 - アルファ
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: Linux
プログラミング言語: C++
トピック: 化学, 分子科学, 物理学
ユーザインタフェース: コマンドライン
登録日: 2011-09-23 01:31
最終更新日: 2016-09-17 17:57

Eos-Image Analysis Environment

Eosは、電子顕微鏡画像処理を中心とした画像処理ソフトウェアパッケージである。C、C++、Tcl/Tkを主体とした言語で作成されている。特に、ユーザーと開発者が一体となった迅速・高効率開発を目的として、自動ソース生成、ヘルプ、ウェブの生成等を機能を備えている。

対象ユーザ: 科学/研究
主要対話語: 日本語
オペレーティングシステム: Cygwin (MS Windows), MacOSX, Linux
プログラミング言語: C, Ruby, Tcl
トピック: 情報分析, 分子科学
ユーザインタフェース: OpenGL, Tk, Web環境
登録日: 2004-10-13 09:06