プロジェクトシンプルリスト ソフトウェアダウンロードマップ

50 件のプロジェクトが条件に合致します
最終更新日: 2007-06-07 03:42

NOCH

NOC はオープン ソース開発ツールキットおよび表示、タンパク質構造の可視化、解析、結晶学的マッピング、モデリング、および洗練された、Gromacs/アンバー MD 軌道の強力な分子エクスプ ローラー映画作り.

(機械翻訳)
最終更新日: 2010-04-27 22:26

NMRShiftDB

NMRShiftDB は、化学構造と核磁気共鳴データについては、オープン ソース、オープン アクセス、オープン提出、オープン コンテンツの web データベースです。

(機械翻訳)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Web環境
最終更新日: 2007-02-22 17:33

PyMOL Plugins

PyMOL Pluginsは、PyMOLの多くのプラグインを提供することを目指します。このウェブサイト上でPyMOLについてより詳細な情報を見つけることができます:http://www.pymol.org/

対象ユーザ: 教育, 健康産業, 科学/研究
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: C++, Python
ユーザインタフェース: Tk
最終更新日: 2015-03-07 05:42

SketchEl

様々なケムインフォマティクスアプリケーションで使用するための化学構造のスケッチツールです。MDL MOLファイルの作成と編集に適しています。

対象ユーザ: 科学/研究
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing
最終更新日: 2018-01-29 11:41

ERmod

ERmod (エネルギー表現モジュール) は、エネルギー表示法による溶媒和自由エネルギーを計算するためのプログラム (j. 化学物理 113、6070 (2000))。プログラムは、不均一系を含む、任意の溶剤の溶媒和自由エネルギーを計算することができる、NAMD、GROMACS やオレンジなどの最先端の分子シミュレーション ソフトウェアとの連携で実行することができます。

(機械翻訳)
最終更新日: 2009-04-14 10:21

DNAStrider

Mac osx 版、もう os9 をサポートしていない Lepard にアップグレードします。このプロジェクトはビルド DNA ストライダー飛竜のヘルプをユーザーが自分のデータを取得し、いくつかの基本的な DNA の実行を分析関数。

(機械翻訳)
データベース環境: SQLite
開発状況: 3 - アルファ
ライセンス: Academic Free License (AFL)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: MacOSX, Linux, Windows XP
プログラミング言語: REALbasic
ユーザインタフェース: Carbon (Mac OS X), KDE, Win32 (MS Windows)
最終更新日: 2018-03-22 08:51

Molby - 分子モデリングソフトウェア

画面上でグラフィカルに分子モデルを組み立てるソフトウェア。Mac OS X と Windows で動作する。GAMESS, Gaussian などの計算化学ソフトウェアとの連携、組み込み Ruby インタプリタによる自動編集などの機能を持つ。 公式ホームページ: http://molby.sourceforge.jp/

開発状況: 4 - ベータ
対象ユーザ: 科学/研究
主要対話語: 英語, 日本語
オペレーティングシステム: MacOSX, Windows XP
プログラミング言語: C, C++, Ruby
トピック: 化学, 分子力学, 分子科学
ユーザインタフェース: wxWidgets
登録日: 2010-01-21 01:18
最終更新日: 2018-05-04 23:51

Toxtree: Toxic Hazard Estimation

化学物質の毒性の危険性を推定する GUI アプリケーションです。最新バージョンは、次の毒性予測モジュールを含む:-Cramer のルール (経口毒性) - Verhaar を介してアクションの毒性モード スキーム - 皮膚の炎症や目の炎症の予測 - ベニーニ/ボッサ ルールベースの変異原性および発がん性の予測-開始の生分解性と永続性の予測-皮膚感反応性ドメイン - クルースは TTC デシジョン ツリー - SMARTCyp - Cytochrome P450-Mediated 薬物代謝と代謝予測-in vivo 小核試験の構造警告アッセイの齧歯動物 (ISSMIC) で-構造アラート機能グループ識別 (ISSFUNC)-結合蛋白結合に関連する構造のアラートDNA の結合。-Ames 変異原性 Toxtree を推定への異なるアプローチを組み込むプラグイン フレームワークを提供します。プラットフォームに依存しない (Java で書かれた) 化学開発キットを使って。

(機械翻訳)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存, OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing
最終更新日: 2009-11-01 23:10

GSLtools

第三の生命鎖である「糖鎖」の質量スペクトルを解析するソフトウェアを開発するプロジェクトです。MALDI-TOF MSやESI-MSなどの質量分析器のデータからタンパク質の分子構造を同定するMS-fitやMascotの様なソフトウェアの技術を応用し開発しています。本プロジェクトにより、バイオインフォマティクス分野において、糖鎖関連の研究が活発化することを期待しています。

本プロジェクトのソフトウェアは下記のサイトに公開しています。 http://www.gsltools.sk.ritsumei.ac.jp/jpn.htm

開発状況: 4 - ベータ
ライセンス: Apache License V2.0
主要対話語: 英語, 日本語
オペレーティングシステム: MacOS, Linux, Windows
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing, Web環境
登録日: 2009-10-25 12:24

MolDS

MolDS("Mol"ecular "D"ynamics simulation package with "S"emiempirical quantum chemistry)を作っています.まだVer. 0.xの開発中ですので, 正式なtarballの配布はしていませんが,ソースコードは以下のSVNリポジトリから誰でも取得できます.



Ver. 0.4(開発中): http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/trunk
Ver. 0.3.1: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.3.1
Ver. 0.3: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.3.0
Ver. 0.2: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.2.0
Ver. 0.1: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.1.0

開発状況: 3 - アルファ
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: Linux
プログラミング言語: C++
トピック: 化学, 分子科学, 物理学
ユーザインタフェース: コマンドライン
登録日: 2011-09-23 01:31
最終更新日: 2016-09-17 17:57

Eos-Image Analysis Environment

Eosは、電子顕微鏡画像処理を中心とした画像処理ソフトウェアパッケージである。C、C++、Tcl/Tkを主体とした言語で作成されている。特に、ユーザーと開発者が一体となった迅速・高効率開発を目的として、自動ソース生成、ヘルプ、ウェブの生成等を機能を備えている。

対象ユーザ: 科学/研究
主要対話語: 日本語
オペレーティングシステム: Cygwin (MS Windows), MacOSX, Linux
プログラミング言語: C, Ruby, Tcl
トピック: 情報分析, 分子科学
ユーザインタフェース: OpenGL, Tk, Web環境
活発さ: 138
活発さ順位: 49位
登録日: 2004-10-13 09:06
最終更新日: 2015-08-24 22:39

mzmatch

mzMatch は小さなコマンドライン ツール メタボロミクス データ分析の特定の Java コレクションです。ツールは、質量分析の特定の機能と PeakML ファイル形式へのアクセスを提供する PeakML コア ライブラリの上に構築されます。

(機械翻訳)
開発状況: 4 - ベータ
対象ユーザ: 開発者, 科学/研究
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: C, Java, S/R
ユーザインタフェース: Java SWT
最終更新日: 2016-12-03 05:56

Avogadro

Avogadroは、計算化学、分子モデリング、バイオインフォマティクス、材料科学、およびそれらの関連分野で使用するための高度でクロスプラットフォームな分子エディタです。柔軟なレンダリングのフレームワークと強力なプラグインアーキテクチャを提供しています。

最終更新日: 2011-12-10 06:18

tem-simulator

フルティルト シリーズ生物試料の透過電子顕微鏡像のシミュレーション。

(機械翻訳)
最終更新日: 2007-12-10 03:55

The Rosetta Molecular Language Framework

ロゼッタは、Java で書かれたオクテットに基づく分子言語フレームワークです。

(機械翻訳)