gnupack

お試しバージョンでCygwinのアプリをインストールしようとすると、apt-cyg(?)がPermission deniedでアクセスできないディレクトリを作成します。
ls -lだとディレクトリのユーザー名が正常に見えるようですが、エクスプローラーでは、NULL SIDになっています。
何が原因でしょうか？

gnupackのバージョン：
- gnupack-pretest_devel-2017.11.19.exe
- gnupack-pretest_devel-2018.06.10.exe

ログ：
# apt-cyg find clang
Cache directory is /setup
Mirror is http://ftp.jaist.ac.jp/pub/cygwin
/app/script/apt-cyg: 193 行: cd: /setup/http%3a%2f%2fftp.jaist.ac.jp%2fpub%2fcygwin%2f/x86: Permission denied
/tmp/tmp.FWyZXibbTB 100%[===================>] 1.29K --.-KB/s 時間 0s
2018-06-16 09:30:55 URL:https://cygwin.com/key/pubring.asc [1324/1324] -> "/tmp/tmp.FWyZXibbTB" [1]
TRUSTEDKEY_CYGWIN: OK
gpg: *警告*: セキュアでないメモリーを使用しています!
gpg: 詳細はhttp://www.gnupg.org/documentation/faq.htmlをご覧ください
gpg: 鍵リング「/setup/.apt-cyg/secring.gpg」ができました
gpg: 鍵676041BA: 公開鍵"Cygwin <cygwin@cygwin.com>"をインポートしました
gpg: 処理数の合計: 1
gpg: インポート: 1
/tmp/tmp.FWyZXibbTB 100%[===================>] 1.66K --.-KB/s 時間 0s
2018-06-16 09:30:56 URL:http://cygwinports.org/ports.gpg [1702/1702] -> "/tmp/tmp.FWyZXibbTB" [1]
TRUSTEDKEY_CYGWINPORTS: OK
gpg: *警告*: セキュアでないメモリーを使用しています!
gpg: 詳細はhttp://www.gnupg.org/documentation/faq.htmlをご覧ください
gpg: 鍵66EE1F94: 公開鍵"Yaakov Selkowitz (Cygwin Ports) <yselkowitz@users.sourceforge.net>"をインポートしました
gpg: 処理数の合計: 1
gpg: インポート: 1
/app/script/apt-cyg: 243 行: pushd: /setup/http%3a%2f%2fftp.jaist.ac.jp%2fpub%2fcygwin%2f/x86: Permission denied
Updating setup.ini
signature verified: setup.bz2.sig
signature verified: setup.ini.sig
/app/script/apt-cyg: 252 行: popd: ディレクトリスタックが空です
Updated setup.ini

Searching for installed packages matching clang:
Warning: /etc/setup/installed.db version is less than 3.
Before continuing, recommend to execute below command:
apt-cyg dist-upgrade
Do you continue? [y/N]
abort
（中略）

# ls -l /setup/http%3a%2f%2fftp.jaist.ac.jp%2fpub%2fcygwin%2f
合計 0
d--Srws--T+ 1 foo None 0 6月 16 09:30 x86/