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プロジェクト概要

Python 高分子ライブラリ (mmLib) は、ソフトウェア ・ ツールキットと解析ルーチンのライブラリと高分子構造モデルでは、Python プログラミング言語で実装されている操作。それは、階層型、オブジェクト指向のアプリケーション プログラミング インターフェイス経由でアクセス mmCIF、PDB、および MTZ ファイルは、図書館の原子要素およびモノマー、生体高分子および OpenGL 分子ビューアーを記述する、オブジェクト指向のデータ構造を解析するための有用なソフトウェア コンポーネントの範囲を提供しています。!MmLib データ モデルは、NMR 蛋白質結晶構造解析のための高度なアプリケーション プログラムの実装に必要な詳細の様々 なレベルに簡単にアクセスを提供するために設計されています、モデリングおよび可視化します。これは蛋白質、DNA、アミノ酸および核酸のための特別なクラスが含まれます。

システム要件

システム要件が設定されていません
プロジェクトのリリース情報やプロジェクトリソースの情報です。
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2007-05-22 06:44
1.0.0

numpyを1.xおよびCIFのファイルのNumericPythonサポートのためのサポート。
タグ: Major feature enhancements
Support for numpy 1.x and NumericPython support for CIF files.

2006-03-07 02:36
0.98

mmLibサブモジュールの一部のモジュールは変更されている1つのディレクトリのレイアウトに、すべてが再分解している。すべてのモジュールでは、SomeModuleインポート*からのを使用し、排除されているすべての輸入が完全に名前空間の汚染を減らすために指定されます。配列ライブラリベクトル、行列に使用さも変更されています。数値のPython numpyパッケージによってscipy.orgスイートから置換されている。
タグ: Major feature enhancements
The mmLib sub-modules have all been re-factored into a single directory layout, and some modules have been renamed. In all modules, the use of from SomeModule import * has been eliminated, and all imports are now fully specified to reduce name space pollution. The array library used for vectors and matrices has also changed. Numeric Python has been replace by NumPy from the scipy.org suite.

2005-07-19 01:10
0.9.7

mmLibコア:様々なバグ修正、パフォーマンスの向上がStructure.py()上のオブジェクトcopy.deepcopyを使用してStructure.pyオブジェクトへのAPIの拡張機能。 tlsviewer.py:現在の作品、霧、、保存することができますおよびビューの方向を復元します。
タグ: Minor feature enhancements
mmLib Core: various bugfixes, performance improvements when using copy.deepcopy() on Structure.py objects, and API enhancements to Structure.py objects. tlsviewer.py: fog now works, and you can save and restore views and orientations.

2005-03-09 06:40
0.9.5

変更主要なAPIの追加、バグフィックス、およびいくつかの新しいサンプルプログラムが含まれます。オーディオコーデックインタフェース今すぐファイルをRCSBている/坑準拠(彼らは)オーディオコーデックインタフェースタグの同じセットを使用すると、tlsviewer.py、いくつかのバグ修正とナビゲーションも改善していたファイルで、structure.pyいくつかのAPIの拡張機能が含まれます。
タグ: Major feature enhancements
Changes include major API additions, bugfixes, and some
new example programs. mmCIF files are now RCSB/ADIT
compliant (they use the same set of mmCIF tags), in the
tlsviewer.py file there were some bugfixes and navigation
improvments , and structure.py includes some API
enhancements.

2004-11-29 22:46
0.9

このリリースでの修正の主なバグとアドレスのAPIの欠陥。これはPython copy.deepcopyのサポート構造体()のオブジェクトは完全ている。これは自動的に単量体ライブラリーの定義から、債券を構築し、間の原子間距離によって共有結合半径を使用して。 AlphaHelix、BetaSheet、およびサイトのクラスに書き直されている。がパフォーマンスの最適化されます。 TLSViewアプリケーションのTLSを剛体モデルをアニメーションに含まれている。
タグ: Major feature enhancements
This release fixes major bugs and addresses API deficiencies. It has full support for Python copy.deepcopy() on Structure objects. It builds bonds automatically from monomer library definitions, and by inter-atomic distance using covalent radii. The AlphaHelix, BetaSheet, and Site classes have been rewritten. There are performance optimizations. The TLSView application is included for animating TLS rigid-body models.

プロジェクトリソース